16 semanas de embarazo y vaginosis bacteriana que no se va con nada.

Hola a tod@s necesito un super consejo, llevo varias semanas con un malestar muy grande en mi zona íntima, al principio me recetaron nistatina por 10 días y a los pocos días de terminar el tratamiento me empecé a sentir mal de nuevo, acudí a un doc general y me recetó nistatina con metronidazol en ovulos por otros 10 días y se repitió la misma historia sólo que ésta mañana tenia un flujo verde que no había tenido. Hoy acudí de nuevo al doctor general y me recetó una tabletas pero la verdad no me dan nada de confianza, algo en mí me dice que le puede hacer daño a mi bebé porque es un medicamento muy fuerte. 
Creen que sea mejor acudir con un ginecólogo y que me dé una segunda opción porque mi ser me dice que el medicamento no es para mi y menos para mi hijo. Gracias.