El pago es así
cuando estás de baja por enfermedad común te paga la SS, aunque dicho dinero te lo ingresa la empresa y luego la SS se lo da a la empresa.
Se cobra, los 3 primeros días de baja nada, del 4 día al 20 día, el 60% de la base de cotización a la SS del mes anterior a la baja y del 21 día en adelante el 75% de dicha base de cotización.
Esto es lo que paga la SS, a mayores, hay empresas, que por convenio colectivo tienen regulado el complementar las bajas hasta el 100%, o sea que la empresa en ese caso pagaría el resto hasta el 100% de la base de cotización, pero esto como te digo, sólo es en las empresas que lo tienen así establecido por convenio, no sé si es tu caso.
Un saludo.