Hola! No entiendo mucho tu caso, como lo expones.
A ver, si sospechas que lo del día 31 no era menstruación, sino manchado por el embarazo, un test de orina, ya daría positivo.
Si fuera tu menstruación, hoy día 9, estarías en fase folicular, empezando la semana sexy (en un ciclo de 28 días de libro, ojo! No todos los ciclos son así, ni todas las chicas lo tienen) , por lo tanto no tendrías síntomas de embarazo.
Otra posibilidad es, que el sangrado ese fuera de ovulación, y si hiciste deberes esos días, te faltaría para la regla pocos días. Y lo último que se me ocurre es que el manchado fuera por algún quiste, mioma, herida, desajuste hormonal, etc. Te aconsejaría que no prestases atención a los síntomas, puesto que suelen ser los mismos en los primeros días que el síndrome premenstrual. Lo del test negativo pero que detecta la hormona!??? Que?? Que valor dió? Por debajo de 5 es negativo