Por lo que yo se
experiencia de mi mejor amiga es lo siguiente:
ella tuvo un bebé y su pareja la abandonó y no quiso reconocerlo ni darle los apellidos así que le puso sus apellidos cambiados, es decir mi amiga se llama Noemí Muñoz Garcia y a la niña la llamó Raquel Garcia Muñoz..
Lo que desconozco es tu pregunta aunque yo también lo pensé poner el apellido primero el del padre (que remedio! aunque si que se puede poner al revés, es decir, primero el de la madre y luego el del padre), y luego el segundo apellido mio. De todas formas supongo que puedes ir a preguntar al Registro Civil o desde internet acceder a su página para ver esta duda.
Saludos.
