Estoy tomando anticonceptivos e igual me baja

Empecé a tomar mis pastillas anticonceptivas el primer día de mi menstruación 
resulta que ya voye por la segunda semana y todavía me baja flujo marrón, todo el tiempo, a que se debe esto?
mantuve relaciones sin protección la segunda semana que había empezado a tomar las pastillas
pero en ningún momento acabo dentro mio
porfavor les agradecería que me contesten y me saquen las dudas
aparte tengo miedo de quedar embarazada 
(las pastillas las tome todos los días a la misma hora siempre y lo sigo haciendo)