¿Desajuste hormonal o futuro embarazo?

No, ese efecto producido por la pastilla, no debes tomarlo como fecha de tu ultimo periodo. La pastilla tiene una carga hormonal enorme así que te va a producir, seguramente, desajustes. Por ello, tendrás que esperar a ver cuándo llega tu siguiente regla y a partir de ahí ya podrás apuntar la fecha como tu última.

¿Ese "sangrado" significa que la pastilla funcionó, y no hay embarazo?

En principio debería ser asi... ¿no has leido el prospecto? De todas formas cuando pasen 20 días de la relación, hazte un test para confirmar o descartar.