Prueba con...
Sentarte con el y haceis una lista de lo que le gusta del cole y lo que no.
Si tiene 3 años hablara bastante y puedes aprovechar y sentarte con el con un lapiz y un papel y explicarle que es un juego y le dices que tu apuntaras en el papel las cosas que le hacen sentir bien en el cole y las cosas que le hacen sentir mal, y cuando tengais la lista echa intentareis buscar una solucion.
Apunta todo lo que te diga, aunque lo consideres una tonteria o creas que se lo ha inventado y una vez terminadas se la lees una por una y le preguntas que solucion cree que es la mejor para evitar esa situacion en los casos de lo que no le guste el cole.
Como por ejemplo, si una de las cosas es que un niño le pega.le preguntas que cree el puede hacer para remediar la situacion. Si te responde varias cosas las apuntas y entre los dos desechais lo que no consedireis bueno, por ejemplo te contesta que el le puede pegar tambien, o decirselo a su seño, o no ir al cole y asi no le pegan mas. Entonces elegis la mejor que seria decirselo a la seño y explicarle el porque las otras dos no una buena solucion.