Mi bebe se returce, se queja y llora de madrugada

Llévalo al médico de nuevo. 

Las intolerancias pueden aparecer en cualquier momento, yo lo llevaría al médico de nuevo.

No está de más una visita al pediatra, pero puede ser parte del desarrollo normal del sistema digestivo.
Como tiene las encias? Tal vez le esté por salir algun diente. Al mio le salieron a los 5 meses y por culpa de ello empezó a tener muchos despertares de noche, y la única forma de que durmiera mejor era pasarlo a mi cama. En la cuna no aguantaba más de una hora.
También tuvo una temporada en la que se despertaba llorando como si lo estuvieran matando, y se calmaba solamente si eructaba, pero eso le pasó cuando ya había comenzado la alimentación complementaria, y le duro unos pocos días.
Que esté varios días sin hacer caca es normal. Si notás su pancita hinchada y dura tiene gases, podés ayudarlo con masajes, en youtube hay muchos videos que enseñan como hacerlos. Yo para simplificar las cosas un poco y ayudarlo le hacía masajes circulares, en el sentido de las agujas del reloj, mientras lo bañaba, aprovechando el agua y el jabón para que mi mano patinara, largaba todos los gasesitos (se veian las burbujas y se aflojaba la panza) y muchas veces hacía caca un rato después.

Las cacas pueden darte una pista también, por cierto.